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光照诱导广叶绣球菌基因组甲基化分析


【发布日期】:2019-01-27 【来源】:食用菌学报
【作者】肖冬来 马璐 张迪 王宏雨 林衍铨
【机构】福建省农业科学院食用菌研究所
摘要:利用荧光标记甲基化敏感扩增多态性技术(fluorescence-labeled methylation-sensitive amplified polymorphism,F-MSAP)比较广叶绣球菌(Sparassis latifolia)菌丝在光、暗条件下基因组胞嘧啶甲基化的变化。F-MSAP分析显示,15对选择性扩增引物共扩增出6383个CCGG位点,平均每个处理每对引物扩增47个条带,其中2849条片段发生甲基化。黑暗组、光照24h和光照48h处理组总甲基化水平分别是49.54%、41.71%和42.88%,黑暗组和光照处理组的总甲基化水平差异显著(P<0.01),而光照组间甲基化水平差异不显著(P=0.10)。与黑暗组相比,光照诱导全甲基化率升高,半甲基化率降低,差异显著(P<0.01)。总的趋势是光照引起广叶绣球菌菌丝DNA去甲基化。
基金:福建省自然科学基金(2016J01133); 福建省属公益类科研院所基本科研专项(2015R1020-5); 福建省农业科学院科技创新团队PI项目(2016PI-44)资助;
关键词:广叶绣球菌; F-MSAP; DNA甲基化; 基因组;
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