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肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定


【发布日期】:2019-01-26 【来源】:菌物学报
【作者】叶丽云 孟国良 程冰 赵丽丽 解凡 吴小平
【机构】福建农林大学菌物研究中心
摘要:线粒体是能量转化与ATP形成的重要场所,已有多种食用真菌的线粒体基因组被相继组装注释,但肺形侧耳的线粒体基因组鲜有报道。本研究对野生肺形侧耳X2菌株的线粒体基因组进行组装并注释,由野生菌株X2与主栽菌株JX线粒体大片段差异序列,构建分子标记来鉴别野生和主栽肺形侧耳菌株。结果显示X2的线粒体基因组为大小75 709bp的闭合环状结构,含有r RNA的大小亚基基因,25个负责携带氨基酸的t RNA基因以及14个常见蛋白编码基因,在cox1基因上含有9个内含子。内含子主要为IB型,包含LAGLIDADG1 superfamily、GIY-YIGCterm superfamily保守结构域。位于菌株X2与JX内含子和基因间区上的大片段差异序列,是造成种内线粒体多态性的主要因素。根据两菌株的差异片段构建系统进化树的结果显示,内含子、rnl-trn X、trn D-atp6序列能够将两株野生菌株和其他主栽菌株区分开,可用于野生肺形侧耳种内鉴定,而且trn D-atp6效果最佳。
基金:秀珍菇品种选育及安全高效关键技术研究(KS115009A)~~;
关键词:野生肺形侧耳; 线粒体基因组; 多态性; 种内鉴定;
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