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  • 基于基因组解析不同香菇菌株木质纤维素降解酶体系的差异


    【发布日期】:2019-01-27  【来源】:Manbetx体育手机版V17版本发布.官网安卓网.香港学报
    【作者】杨瑞恒 李焱 吴莹莹 唐利华 尚俊军 鲍大鹏
    【机构】上海市农业科学院Manbetx体育手机版V17版本发布.官网安卓网.香港研究所农业部南方Manbetx体育手机版V17版本发布.官网安卓网.香港资源利用重点实验室国家Manbetx体育手机版V17版本发布.官网安卓网.香港工程技术研究中心国家Manbetx体育手机版V17版本发布.官网安卓网.香港加工技术研发分中心 上海市农业遗传育种重点开放实验室
    摘要:通过比较香菇(Lentinula edodes)野生菌株L3,NCBI已公布的菌株135A、135B、B17、NBRC 111202、W1-26,木腐菌金针菇(Flammulina velutipes)、糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus),以及草腐菌双孢蘑菇(Agaricus bisporus)、灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)、草菇(Volvariella volvacea)的基因组。结果表明:香菇不同菌株间基因组存在较大差异,大小为36.69~46.11 Mb,基因数量为11192~14889;香菇菌株135A、135B、B17、L3、NBRC 111202和W1-26基因组注释的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)基因数量分别为520、520、483、475、524和537,其中L3最少,为475;纤维素酶在香菇不同菌株中基因数量为19~22,低于灰盖鬼伞和草菇,高于双孢蘑菇;不同香菇菌株的氧化还原酶基因数量为41~55,L3最少,为41,NBRC111202最多,为55,135A和135B最为接近。在基因水平上,木腐菌与草腐菌的木质纤维素降解酶体系没有完全的界限,它们之间存在一定的共性,因此木腐菌草腐化栽培存在可能性。 
    基金:上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字(2017)第1-8号]; 上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2016)第6-1-3号];
    关键词:碳水化合物活性酶; 纤维素酶; 木质素酶; 氧化还原酶;
     
     
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