药用真菌的人工栽培，因真菌的种类、营养类型、环境条件及培养料的不同有多种多样方式。主要的栽培方式有段木栽培、代料栽培和深层培养菌丝体。段木栽培是以原木等为栽培材料，人工接种，适用于林区。代料栽培是以工农业生产的废弃物如锯木屑、棉籽壳、甘蔗渣、玉米芯、农作物秸秆、麦麸等为原料，进行人工接种，可控性强，受自然条件影响较小，适应性广。以上两种均为在固体培养料上栽培，以获得子实体和菌核为目的。有些药用真菌目前还未能掌握其子实体形成的条件，其菌丝体或生长代谢产物具有一定的生理活性，而采用液体发酵或固体发酵方式进行生产。
一、段木栽培
采用段木栽培的药用真菌有灵芝、香菇、黑木耳、银耳、金耳、猪苓、茯苓等。其生产工艺流程包括栽培场地的选择、整理，段木的菌种准备，段木的人工接种，培菌起架管理，病虫害防治及采收加工等。
1.栽培场地选择和整理 创造适宜药用真菌生长的环境，选择地势相对较高、离水源近同时易于排水、周围环境清洁、通风良好的场地，根据药用真菌的生物学特性，不同种药用真菌其栽培场地的选择也有区别。