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基于全基因组数据解析伞菌目木质纤维素降解酶系的差异


【发布日期】:2019-01-24 【来源】:菌物学报
【作者】杨瑞恒李燕唐利华李传华鲍大鹏
【机构】国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所
摘要:伞菌目Agaricales隶属于担子菌门Basidiomycota、伞菌亚门Agaricomycotina,是担子菌门中最大的一个类群,能够以腐生、寄生以及共生的模式在自然环境中生存,生存范围广,对于维持生态环境的平衡具有重要的作用。本研究基于51株伞菌目真菌基因组大数据挖掘降解木质纤维素相关的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)和氧化还原酶(oxidoreductases),同时比较白腐菌、褐腐菌、腐生菌、菌根菌、植物致病菌、兼性寄生菌、动物共生菌和不明生态型真菌降解机制的差异。结果显示白腐菌和褐腐菌等木腐菌、菌根菌、兼性寄生菌、其他腐生菌、植物致病菌以及共生菌的CAZymes家族平均数目为134个、93个、101个、127个、61个和32个,而CAZymes同源的基因平均数目为398个、240个、463个、407个、418个、131个和38个,木腐菌的CAZymes家族最为丰富,但是兼性寄生菌基因数目最多;同时具有木质纤维素降解酶活性的26个家族中,基因数目分别为86个、32个、101个、86个、104个、36个和10个。在木腐... 更多
基金:上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2016)第6-1-3号; 沪农科攻字(2015)第6-2-1; 沪农科攻字(2014)第7-1-6]; 上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字(2015)第1-9号]; 国家食用菌工程研究中心(16DZ2281300)~~;
关键词:基因组规模; 伞菌目; 碳水化合物活性酶; 氧化还原酶;
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