木霉至今没有理想的根治性药物。因此，创造适合香菇菌丝生长而不利于木霉繁殖的生态环境，是控制危害的根本措施。一旦发生木霉为害，要立即通风降湿，以抑制木霉菌的扩展，处于发菌阶段的培养料感病以后，可采用注射药液的方法抑制木霉扩张，常用的药液有5%的石碳酸、2%的甲醛、1：200倍的50%多菌灵、75%甲基托布津、ph值为10的石灰水，此外，往污染处撒白灰面，防治效果也很好。