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华南瓜类疫霉的RAPD遗传多样性分析


【发布日期】:2019-01-21 【来源】:菌物学报
【作者】吴永官 蒋雅琴 黄思良 车江旅 付岗 胡春锦 黎炎
【机构】广西农业科学院蔬菜研究所 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室 南阳师范学院生命科学与技术学院 广西农业科学院微生物研究所
摘要:为了解来自广东和广西的瓜类疫霉的遗传多样性,利用从180条RAPD引物中所筛选出的多态扩增性强、重复性好的12条引物,对分离自两省区的96株瓜类疫霉进行了全基因组DNA遗传多样性分析和指纹图谱构建。通过对供试菌株的RAPD-PCR扩增,共获得135条DNA标记谱带,其中124条为多态性谱带,多态检测率为91.9%。利用NTSYSpc Version2.1软件对供试菌株间的遗传距离进行聚类分析并构建系统树,以遗传相似系数0.81为阈值,将96个供试菌株划分为12个RAPD群,多数分离物之间遗传相似性较低,在DNA水平上存在显著的遗传变异,具有较丰富的遗传多样性。不同地区间菌株的遗传分化程度不同,分离自黄瓜的菌株遗传分化明显高于分离自冬瓜的菌株。RAPD群与菌株地理来源、分离寄主、致病力、交配型及甲霜灵抗性均无明显的相关性。
基金:国家自然科学基金(81360431); 广西自然科学基金(2012GXNSFBA053060); 广西科技攻关计划(桂科攻1222009-3C); 广西农业科学院科技发展基金(桂农科-2012JM01和桂农科-2013JZ04);
关键词:瓜类疫霉; 遗传多样性; RAPD分析; 遗传距离; 黄瓜; 冬瓜;
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