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草菇exo-β-1,3-葡聚糖酶基因可变剪接体的克隆与表达分析


【发布日期】:2019-01-25 【来源】:菌物学报
【作者】陶永新 仝宗军 邵颜平 严俊杰 黄千慧 谢宝贵
【机构】福建农林大学园艺学院福建农林大学菌物研究中心
摘要:可变剪接是基因表达调控的一种重要方式。本研究利用RT-PCR克隆鉴定到草菇exo-β-1,3-葡聚糖酶基因(exg2)的4种可变剪接体(exg2V1,exg2V2,exg2V3和exg2V4),其中,exg2V1第7个内含子保留;exg2V2第11个内含子保留同时剪切掉第12个外显子的后58bp;exg2V3同时保留第7个和第17个内含子;exg2V4同时保留第2、第9和第17个内含子。4种剪接体均在可变剪接位点提前出现终止密码子,导致预测编码的氨基酸序列中包含不完整的结构域。定量PCR结果显示:草菇5个发育时期中,4种可变剪接体表达量均比标准剪接体exg2低,但4种可变剪接体的表达也表现出一定的时期和组织差异性。初步推断发现的草菇exg2基因4种可变剪接体均为无义介导的mRNA降解,通过此方式达到对exg2基因标准剪接转录本的精准调控。
基金:福建农林大学园艺学院青年学术骨干培养基金(61201400706); 国家重点基础研究发展计划项目(2014CB138302); 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS24)~~;
关键词:可变剪接; 子实体发育; 无义介导的mRNA降解; 定量PCR;
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