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IGS2-RFLP、SCoT和ISSR在白灵侧耳遗传多样性分析中的比较研究


【发布日期】:2019-01-18 【来源】:菌物学报
【作者】赵梦然 陈强 张金霞 邬向丽 黄晨阳
【机构】中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 农业部农业微生物资源收集与保藏重点实验室
【摘要】应用IGS2-RFLP、SCoT和ISSR标记分析新疆5个采集地点的28个白灵侧耳野生样本的遗传多样性,比较这3种分子标记在白灵侧耳种质资源遗传多样性研究中的效用。结果显示,IGS2-RFLP的3个内切酶、5个SCoT引物、5个ISSR引物分别检测到42、59和77条多态性条带,多态性比率分别为91.3%、92.4%和92.8%。3种标记检测出的有效等位基因数(ne)和位点平均的预期杂合度(Hep)没有显著性差异。表明3种标记都适宜作为遗传学标记对白灵侧耳野生种质进行多样性分析。多态性检测效率最高的标记为ISSR,E=15.4,Ai=23.4,其次为IGS2-RFLP,E=14.0,Ai=22.4,SCoT则为最低,E=11.8,Ai=18.2。3种标记中,SCoT和ISSR标记的聚类结果极其相似,且均能较为准确地反映样本的地理来源,虽然二者的聚类图不完全相同。IGS2-RFLP的标记效率较高,准确性和可重复性最好,可用于菌株标准图谱的制作,更适用于品种权保护中的菌株鉴定鉴别;SCoT和ISSR标记的多态性高,信息量大,评价范围广,则更适用于白灵侧耳种质资源的遗传多样性研究。
【基金】现代农业产业技术体系(No.CARS-24);
Manbetx体育手机版推荐A9版本野生样本; 多态性; 有效等位基因; 预期杂合度;
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