这是一个老生常谈的问题，很难有所定论，有人说适用的才是最好的，不无道理，能否找出更科学的定律，欢迎大家踊跃发言。
当前的二三级菌种容器五花八门，笔者所见所闻，归纳一下几种：
1、食用菌专用玻璃菌种瓶 最早的科研单位和不少菇农原种所常用，优点是口径适合，装料速度也可以，玻璃导热性好，灭菌容易彻底，瓶保水性能好，杂菌易观察。缺点是价格较高，不易购买，容易破损，清洗麻烦。
2、500毫升输液瓶 最早被产区菇农原种广泛采用，优缺点基本同食用菌专用玻璃菌种瓶，但只是口径小，杂菌更不易侵染，但缺点也是口径小，装料费时。这些瓶多从废品站、医院、兽医站收购，价格较低廉，但也存在者目前的医院多改用输液袋或250毫升小输液瓶，货源开始紧张的问题。
3、食用菌专用塑料瓶 这种容器继承了玻璃瓶的优点，避免了玻璃瓶的缺点。被不少从业者津津乐道。但也存在价格高、瓶冲洗费劲的问题。
4、17*33聚丙烯或聚乙烯袋 在很多菇农原种栽培种所采用，优点是装料多、方便、价格低廉和接种方便，在产区被广泛使用，但污染率高于瓶这是个不争的事实。应注意在培养料含水量上要与瓶有所区别。
5、23*50聚乙烯大袋 这种方式见于有些菇农平菇的三级种，我对此持有看法，袋大是装料多，省工省时，但谁能保证灭菌彻底呢？
6、15*58聚乙烯长袋 这种方式多为长春市香菇业户三级种所采用，其基本操作实质上就是香菇菌棒生产模式，这种方式是否科学，笔者最不好定论。