1.木霉。培养料被木霉侵染后，先产生白色棉絮状菌丝，后从菌丝层中心向四周扩展至边缘呈浅绿色，最后转为深绿色，且出现粉状分生孢子。
防治方法：一是保持场地及工具洁净，经常对培养室、栽培场、工具等进行消毒，保持周围环境洁净。
二是培养料消毒处理，配制培养料时，按其干重加入0.1%的50%可湿性多菌灵，也可使用0.1%的甲基托布津拌料。
三是药剂防治，当木霉已侵染到料内，要轻轻将其挖掉，然后再喷洒、涂抹800倍液的50%多菌灵可湿性粉剂、200倍液的克霉灵或喷洒10%的石灰水防治。
四是消除污染的菌盘，如果被木霉传染特别严重，不易防治的，可深埋或烧掉菌盘，防木霉菌孢子散发、蔓延。
2.链孢霉。链孢霉也叫红色面包霉，这种霉生长特快。发病初期呈白色黏糊状。在条件适宜时5-10天形成橘黄色面包状物，严重时由接种点或栽培袋破损处长到袋外，形成巨大的橘黄色菌落，碰触后孢子很容易散发到空气中。
防治方法：一是做好培养菌盘的生产场地环境卫生，定期进行消毒，不给链孢霉滋生和传播机会。
二是严格灭菌、接种，培养料要灭菌彻底，接种人员严格进行无菌操作。
三是注意排湿，要注意培养室的通风、排潮，降低室内湿度，必要时还可在培养室内外及菌盘上撒石灰粉降湿。
四是药剂处理。培养室局部发生链孢霉时，最忌用喷雾器等药械直接向污染处和培养室内喷射杀菌药物，因为此时表面喷洒用药效果欠佳，同时也会引起分生孢子扩散，污染环境，造成更严重的污染。菇房可用800倍液的霸力进行空间消毒。将出现的链孢霉用柴油涂抹，然后用烟雾消毒剂一消灵或百菌清进行室内密闭熏蒸消毒，可控制病菌扩展。
