一些老菇场由于灭菌消毒不彻底，病害防治不到位，害虫发生严重等原因，产量不断下降，效益降低。应采取有效措施，保证老菇房成功发菌，增加效益。
外围环境消毒 清洁菇棚周围环境。粪堆、草堆、垃圾等应清理干净，将杂草一并清除，并喷洒多菌灵等杀菌剂，彻底清洁环境。
棚内消毒 用多甲溶液（多菌灵、甲醛、水比例1∶2∶100）对棚内进行地毯式喷洒，墙体、墙角、立柱、通风孔等都应喷到，不留死角。对于土棚，应把内墙面铲去3～5厘米厚再消毒。
晒棚 出菇结束后，揭掉遮阳物和棚膜，对可拆的竹木拆掉后用0.1％～0.2％高锰酸钾溶液洗刷干净，利用太阳强光长时间暴晒竹木和菇棚（可雨淋）。10～15天后启用。该项措施能够较彻底杀灭棚内病毒、病菌。
更换架杆棚膜 对病害发生严重的菇棚，可拆除上层架杆、塑料膜等物，棚内堆以秸秆杂草，点燃焚烧，将草灰翻入土中，重新架杆覆膜，再配以喷洒药物，杀菌效果很好。靠近村庄、建筑物的菇棚不要采用该法，以免发生火灾。
土壤处理 对于必须采用覆土栽培的菇类（双孢蘑菇、鸡腿菇等）和采用覆土方式栽培的菇类（平菇、高温香菇、灵芝等），对覆土材料宜采用暴晒、药物闷堆的方法消毒灭菌。铲去老菇棚内10厘米以上的地表土，更换新土，或对地表土进行与覆土材料相同的处理。
