食用菌生态学研究食用菌生活习性与其周围物理环境、化学环境及生物环境之间的相互关系，其目的是为了揭示食用菌的生活习性、种群结构、自然分布与发生规律；食用菌生态学是食用菌学的一个重要分枝学科，对食用菌的驯化、栽培和开发利用具有十分重要的指导作用。食用菌与其它生物一起够成了其生活的群落，每一种食用菌均生活在一种特定的群落中，受群落内各种因素的影响，而且作为环境的一个重要组成部分，食用菌在其生长发育过程中也必然会对其生活的环境发生影响。食用菌按其生活环境可分为林地真菌（如松茸、块菌等）、木材腐朽菌（如香菇、金耳、木耳等）、草原蘑菇、田野蘑菇、粪生蘑菇、菌根真菌、虫生真菌（如虫草、蝉花等）、沙丘真菌、洞穴真菌几种类型，但这些类型间有时没有明显的界限。了解食用菌的生态类型，有利于野生食用菌的人工驯话和栽培。
按其与其它物种的关系及营养方式，食用菌又可分为共生食用菌、腐生食用菌、寄生食用菌等，其中腐生食用菌在自然界物质循化中占有重要的地位，大多数食用菌为腐生菌。影响食用菌生长发育、传播繁衍的环境因素有物理因素、化学因素和生物因素三种。理化因素包括温度、水分、湿度、酸碱度、氧及二氧化碳浓度、光照、营养条件等，生物因素包括食用菌与植物、动物及微生物之间的关系，这些关系或为竞争、或寄生、或中性、或共栖、或共生、或兼而有之。
生态环境对野生食用菌的空间分布格局具有直接的影响。食用菌的分布同地理纬度、海拔高度、地形地貌、植被类型、土壤结构、土壤酸碱度、土壤肥力、土壤微生物等都具有密切的关系。如海拔高度直接影响到食用菌的垂直分布：在海拔2000米以上地区，食用菌的种类和个体都很少。气候条件虽不如地理环境那样直接作用于食用菌种群的分布，但能明显地影响到食用菌的个体发育。在季节性明显的地区，食用菌的出现有明显的季相，例如金针菇、侧耳、香菇等通常出现于早春及深秋；松乳菇等多出现于初夏和早秋。不同年份雨量和温度的变化也会造成食用菌发生时间的规律性变化。即使在同一地区，也往往因种类和数量上的变化，出现"大年"或"小年"。
