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隐匿柄锈菌(小麦叶锈病菌)UP-PCR遗传多样性分析


【发布日期】:2019-01-21 【来源】:菌物学报
【作者】张林亚 孟庆芳 康健 杨文香 闫红飞 刘大群
【机构】河北农业大学植物保护学院 国家北方山区农业工程技术研究中心 河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心
摘要:小麦叶锈病是世界麦区普遍发生的病害。以2008年采集于河北省的29个隐匿柄锈菌(小麦叶锈病菌)单孢子堆分离菌系为试验材料,利用39个小麦抗叶锈近等(单)基因系和7个UP-PCR(Universally Primed PCR)引物对其进行毒性多态性和分子多态性分析。7个UP-PCR引物共检测出48条条带,其中多态性条带41条,多态性百分率为85.42%,表明UP-PCR在隐匿柄锈菌中扩增多态性较高;经聚类分析,遗传相似系数为0.69–0.90,在相似系数0.72处,29个叶锈菌株聚为6组,体现了隐匿柄锈菌菌株间的亲缘关系和差异性,表明UP-PCR技术可用于小麦叶锈病菌群体遗传多样性研究。在物种水平上,隐匿柄锈菌观察等位基因数(Na)为1.85,有效等位基因数(Ne)为1.29,Nei's基因多样性指数(H)为0.19,Shannon信息指数(I)为0.31,多态位点百分率(P)为85.42%,表明隐匿柄锈菌遗传多样性丰富,其中沧州的群体遗传多样性水平最高,群体内多样性大于群体间多样性。聚类分析表明沧州和石家庄的病菌群体亲缘关系最近,邢台与石家庄的群体亲缘关系最远。隐匿柄锈菌UP-PCR多态性与毒性多态性间无明显相关性,且两者均与地理来源无相关性。
基金:国家重点基础研究发展计划(2013CB127700); 河北省留学人员科技活动项目择优资助项目(20120340); 河北省高等学校科学技术研究项目(QN20131094); 教育部博士点基金(2010130212005);
关键词:隐匿柄锈菌; 小麦叶锈病; 通用引物; 毒性鉴定; 遗传结构;
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