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基于rDNAITS序列分析Alternaria与相似属的关系及A.leucanthemi的分类地位


【发布日期】:2018-03-27 【来源】:菌物学报
【作者】赵国柱 张天宇 曹爱新 王洪凯
【机构】山东农业大学植物病理学系 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室 山东农业大学植物病理学系 山东泰安271018 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室 北京100080
【摘要】对Alternaria,Stemphylium,Ulocladium,Nimbya,Embellisia等五个形态相似属的代表性种进行了5.8S/ITS区段序列测定,连同从GenBank下载的相关有性型Pleospora,Lewia的同项资料,由Neighbor-joining方法构建系统发育树。序列对比结果显示,所有参试的菌株/种的5.8SrDNA序列保守程度较高,ITS序列变化较大,ITS1比ITS2变化更大。由5.8S/ITS构建的系统发育树可以足够将供试菌区分到属;系统发育树显示Alternaria,Ulocladium,Nimbya和Embellisia系统学关系较近,又存在一定的分化;Stemphylium聚在相对较远的分支上,与上述四属关系较远,相对独立进化;有性型的Pleospora与无性型的Stemphylium被聚到一个分支,这种不同阶段菌株在遗传基础上的一致,充分证明所用方法及所选测序的rDNA区段对本类群真菌的分类很有价值。Alternarialeucanthemi位于系统发育树的外侧,较为独立进化,与Alternaria的其它种亲缘关系较远,却与Stemphyliumspp.和Bipolarisspp.关系较近,对其目前的分类地位提出质疑。
【基金】国家自然科学基金项目(39899400); 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室(915)课题资助;
Manbetx体育手机版V17版本发布.官网安卓网.香港链格孢属; 匍柄霉属; 假格孢属; 埃里格孢属; 细基格孢属; 系统学;
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