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不加权组平均法在云南山地小型真菌生物多样性研究中的应用


【发布日期】:2018-02-02 【来源】:菌物学报
【作者】李文鹏 周应揆 李明春 邢来君
【机构】南开大学微生物系 云南大学工业微生物发酵工程重点实验室 南开大学微生物系 天津300071云南大学工业微生物发酵工程重点实验室昆明650091天津300071
【摘要】通过RAPD分析对38个不同寄主来源的弯孢类炭疽菌菌株的系统发育及分类进行研究。结果表明:许多引物的RAPD扩增带型在种内是相似或一致的,而种间差异较大。UPGMA聚类分析的结果表明:38个弯孢类炭疽菌菌株被聚为6个类群,群内菌株之间遗传相似性较高,而群间遗传相似性较低;群与群之间分界明显,表明种的分界相当明显。因此,RAPD分析所反映的种间亲缘关系,将有助于疑难种分类地位的确定和近似种的区分。RAPD分析的结果还揭示了一些近似种的分类关系,如按传统方法分别鉴定为Colletotrichumtruncatum、C.circinans和辣椒炭疽菌C.capsici的许多菌株聚类在同一群内,有很高的遗传相似性,实验结果支持它们为同一个种。实验中还发现5条辣椒炭疽菌的特有片断,分别由引物OPE-14、OPH-15(2条)、OPM-12和OPM-20扩增产生。这些特异带的发现对该菌的快速检测和鉴定具有重要意义。
【基金】国家自然科学基金项目(3870062);
ManBetX体育山地生态系统; 热带; 亚热带; 香农指数;
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